Buscamos compreender mecanismos fundamentais da química e da física biológica, em diferentes escalas de tempo e tamanho:
- Elétrons em macromoléculas. Um dos maiores desafios da ciência moderna é desvendar o poder catalítico das enzimas. Entender como proteínas aceleram reações químicas inclue estudar o que os “elétrons estão fazendo” no sítio ativo destas macromoléculas. Além das proteínas-fosfatases, atualmente nos interessamos pela simulação de enzimas que usam grupos metálicos para catálise e transferência eletrônica, como aquelas envolvidas na fotossíntese e na respiração celular.
- Proteínas e reconhecimento molecular. Proteínas podem ser consideradas nano-máquinas que funcionam graças a sua movimentação. Portanto, investigamos qual o papel da flexibilidade estrutural destas macromoléculas na formação de complexos entre proteínas ou com pequenas moléculas como fármacos e inibidores.
- Teoria e simulação (QM/MM) de catálise e reatividade química;
- Proteínas contendo grupos metálicos;
- Ligação de inibidores a proteínas flexíveis;
- Software: Biblioteca pDynamo e outros desenvolvimentos.
Reportagens externas:
- Artigo na Nature Comm., pela Agência FAPESP – 24/Jul/2015
- Artigo na Nature Comm., pela Agência USP de notícias – 02/Jul/2015
- Nobel de Química, pela Agência universitária USP – 06/Nov/2013
- Nobel de Química, pela Folha de S. Paulo – 10/Out/2013
- Nossa pesquisa, pelo Portal da USP – 03/Out/2013
- Nossa pesquisa, pela Agência universitária USP – 10/Out/2012
