Pesquisa

Buscamos compreender mecanismos biomoleculares fundamentais, em diferentes escalas de tempo e tamanho:

  • Reações químicas em enzimas e macromoléculas: Desvendar o poder catalítico de enzimas é um dos maiores desafios da ciência moderna. Entender como proteínas aceleram reações químicas inclue estudar o que os “elétrons estão fazendo” no sitio ativo destas macromoléculas. Hoje investigamos principalmente metaloenzimas contendo clusters de ferro-enxofre, como aquelas envolvidas na fotossíntese e na respiração celular.

  • Bioenergética molecular: Nos útlimos anos nos debruçamos sobre os complexos respiratórios mitocondriais, os principais componentes da cadeia de transporte de elétrons na respiração celular. Empregamos diversos tipos de simulações moleculares para compreender seus mecanismos redox e de catálise, e a inibição dos complexos por pequenas moléculas.

  • Desenho de novas drogas e reconhecimento molecular: Flutuações estruturais determinam o mecanismo de ação de biomoléculas. Aqui investigamos como estas flutuações participam da formação de complexos com pequenas moléculas como substratos, inibidores ou possíveis fármacos. Como aplicação prática, buscamos desenvolver novas drogas e compostos com atividade biológica melhorada.
  1. Teoria e simulação (QM/MM) de catálise e reatividade química;
  2. Bioenergética molecular computacional;
  3. Ligação de pequenas moléculas a proteínas;
  4. Software: Biblioteca pDynamo e outros desenvolvimentos.

Reportagens externas:

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