A primeira mini-escola paulistana de inteligência artificial e simulação computacional de biomoléculas será organizada pelo Laboratório de Bioquímica e Biofísica Computacionais como um curso introdutório de extensão com ênfase em aulas práticas.
Data e horário: 24, 25 e 26/Julho/2024 (quarta à sexta-feira), manhã e tarde.
Local: Instituto de Química (IQ-USP), presencialmente no Laboratório de Bioquímica e Biofísica Computacionais.
Inscrições:
- Encerradas. Aguarde a divulgação da seleção até dia 05/Julho.
- A participação na escola é gratuita
- Público-alvo: Estudantes de graduação (no último ou no penúltimo ano) e de pós-graduação
- Ajuda de custo (até R$500) está disponível para participação presencial
Conteúdo:
- Breve introdução à interpretadores de comandos: Bash, Python e notebooks Jupyter;
- Introdução a Machine Learning: Classificação e regressão. Redes Neurais;
- Simulações e inferência baseadas em informação. Prática de previsão de estrutura proteica com AlphaFold, e modelos difusionais e de linguagem de proteínas;
- Simulações baseadas em energia e estrutura molecular: Métodos clássicos (MM), quânticos (QC) e híbridos (QM/MM);
- Exploração de híper-superfícies (de energia ou de parâmetros). Práticas de simulação de dinâmica molecular com pacote GROMACS e a biblioteca pDynamo;
Palestrantes:
- Prof. Guilherme M. Arantes (IQ-USP)
- Prof. Luis Gustavo Dias (FFCL-USP/RP)
- Prof. Lucas Ducati (IQ-USP)
